Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl6Q91WC3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsl6Q91WC3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms