Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp3Q91W36 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp3Q91W36 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms