Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn3Q91V61 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn3Q91V61 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms