Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SelenomQ8VHC3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SelenomQ8VHC3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms