Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc115Q8VE99 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms