Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt25Q8VCW2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt25Q8VCW2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms