Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam20bQ8VCS3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms