Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med17Q8VCD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms