Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc9Q8VC31 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc9Q8VC31 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms