Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmx1Q8VBT0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmx1Q8VBT0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmx1Q8VBT0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmx1Q8VBT0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmx1Q8VBT0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmx1Q8VBT0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmx1Q8VBT0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmx1Q8VBT0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmx1Q8VBT0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms