Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gipc3Q8R5M0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gipc3Q8R5M0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms