Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Top1mtQ8R4U6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Top1mtQ8R4U6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top1mtQ8R4U6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Top1mtQ8R4U6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Top1mtQ8R4U6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Top1mtQ8R4U6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Top1mtQ8R4U6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top1mtQ8R4U6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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