Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
0610009B22RikQ8R3W2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
0610009B22RikQ8R3W2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms