Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms