Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dnaaf4Q8R368 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnaaf4Q8R368 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf4Q8R368 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnaaf4Q8R368 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms