Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc12Q8R344 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms