Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Impg1Q8R1W8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Impg1Q8R1W8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms