Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg10Q8R1P4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms