Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh16f2Q8K3M1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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