Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sde2Q8K1J5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sde2Q8K1J5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms