Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34c1Q8K193 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms