Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmbrd1Q8K0B2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms