Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf628Q8CJ78 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms