Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TwnkQ8CIW5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms