Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SbsnQ8CIT9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SbsnQ8CIT9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SbsnQ8CIT9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SbsnQ8CIT9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbsnQ8CIT9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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