Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ercc8Q8CFD5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc8Q8CFD5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms