Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrn3Q8CBC6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms