Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apoa5Q8C7G5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apoa5Q8C7G5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms