Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrbnQ8C7D2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrbnQ8C7D2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms