Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot2Q8C5L3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot2Q8C5L3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms