Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp37Q8C0R0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms