Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek11Q8C0Q4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek11Q8C0Q4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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