Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx16Q8C080 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx16Q8C080 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms