Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms