Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TtpaQ8BWP5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtpaQ8BWP5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms