Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snx17Q8BVL3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx17Q8BVL3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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