Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmod1Q8BVA4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod1Q8BVA4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms