Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcgF3Q8BTQ0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms