Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pbrm1Q8BSQ9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pbrm1Q8BSQ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms