Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zcchc4Q8BKW4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms