Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spock3Q8BKV0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spock3Q8BKV0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms