Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra5Q8BHJ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra5Q8BHJ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms