Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Htatsf1Q8BGC0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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