Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms