Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg4cQ811C2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg4cQ811C2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms