Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc172Q810N9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc172Q810N9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms