Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms