Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5bQ80Y84 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm5bQ80Y84 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm5bQ80Y84 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm5bQ80Y84 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms