Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll4Q80UG8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll4Q80UG8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttll4Q80UG8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttll4Q80UG8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttll4Q80UG8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll4Q80UG8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms