Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lamp3Q7TST5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lamp3Q7TST5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms